父亲原籍上海，电气工程师，从事设计核电站。母原籍上海，大学心理学教授。2个姐姐分别年长吴彦祖10年、12年。妻子Lisa.S，中法犹混血儿，身高178cm曾拍摄过很多的平面广告。女儿Raven Wu（中文名：吴斐然）2013年5月30日出生。
婚姻
2010年4月6日，吴彦祖与女友LisaS在南非举行婚礼。2010年7月28日晚，吴彦祖与 Lisa.S在香港补摆喜宴。
2012年12月7日吴彦祖太太lisaS.刚刚宣布怀孕三个月后出席公开活动，吴彦祖公开表示要停工一年在家里带孩子。
2013年6月3日，吴彦祖在网上晒出新生女儿小手照，并宣布他们的健康女儿Raven Wu 已经出世了。
据香港媒体报道，吴彦祖3个月前得悉母亲大肠癌症复发，立刻带妻女赶赴三藩市照顾母亲。为了专心在美照顾两老，他还解散了经理人公司，将暂别乐圈一段时间，但想不到其母病情加速恶化，上月底已经离世。
据知情人士透露，吴彦祖一向很孝顺，母亲弥留时，他与家人一直守候在侧。85岁的吴母走得安详，但吴彦祖十分伤心。
